Thủ tục cấp giấy chứng nhận an toàn thực phẩm đang gây khó khăn cho doanh nghiệp xuất khẩu nông sản sang EU. Sau khi thay đổi Bộ quản lý, thủ tục này được chuyển xuống địa phương, gây vướng mắc cho doanh nghiệp tại TPHCM. Nhiều sản phẩm nông sản bị mắc kẹt, hư hỏng do lưu kho quá lâu trong khi chưa được giải quyết.
“Từ Nghị định 167/2025/NĐ-CP, đại lý hải quan không còn được công nhận là doanh nghiệp ưu tiên. Nghị định mới sửa đổi các điều kiện về tờ khai hải quan để được công nhận doanh nghiệp ưu tiên, bao gồm: kim ngạch xuất khẩu và nhập khẩu tối thiểu là 100 triệu USD/năm; 40 triệu USD/năm đối với hàng hóa sản xuất tại Việt Nam; 30 triệu USD/năm với hàng nông sản, thủy sản sản xuất tại Việt Nam, tính bình quân 2 năm liên tục, không bao gồm ủy thác.”
Nhiều mặt hàng nông sản Việt Nam xuất khẩu sang châu Âu bị tạm dừng do thủ tục xuất khẩu từ 1/7 gây thiệt hại kinh tế cho doanh nghiệp và ảnh hưởng thị trường xuất khẩu.