Các nhà nghiên cứu tại Viện Salk đã tạo ra một bước tiến quan trọng trong việc tìm kiếm các microprotein có thể đóng vai trò trong bệnh tật bằng cách phát triển một công cụ mới tên là ShortStop. Công cụ này tận dụng sức mạnh của học máy để khám phá những vùng DNA thường bị bỏ qua trong các nghiên cứu trước đây. Mục đích chính của ShortStop là xác định các vùng DNA có khả năng mã hóa microprotein và dự đoán tiềm năng sinh học của chúng, từ đó giúp tiết kiệm thời gian và chi phí trong quá trình nghiên cứu các microprotein liên quan đến sức khỏe và bệnh tật.
ShortStop hoạt động dựa trên việc phân loại microprotein thành hai loại chính: chức năng và không chức năng. Quá trình phân loại này được thực hiện thông qua dữ liệu huấn luyện lấy từ các bộ dữ liệu ngẫu nhiên được tạo ra bởi máy tính. Bằng cách so sánh các microprotein tìm thấy với các mẫu giả, ShortStop có thể nhanh chóng quyết định liệu một microprotein mới có khả năng chức năng hay không. Điều này đánh dấu một sự đổi mới đáng kể trong cách tiếp cận nghiên cứu microprotein, vì các phương pháp truyền thống thường tốn nhiều thời gian và tài nguyên.
Khi áp dụng ShortStop vào một bộ dữ liệu đã được công bố trước đó, các nhà nghiên cứu đã đạt được kết quả đáng kể. Họ xác định được khoảng 8% microprotein có khả năng chức năng, và ưu tiên chúng cho việc theo dõi tiếp theo. Điều đáng chú ý là công cụ này cũng giúp xác định các microprotein bị bỏ qua bởi các phương pháp khác, bao gồm cả một microprotein đã được xác nhận bằng cách phát hiện trong các tế bào và mô của con người. Điều này cho thấy tiềm năng của ShortStop trong việc mở rộng kiến thức về microprotein và vai trò của chúng trong sinh học.
ShortStop đã được ứng dụng để phân tích dữ liệu di truyền từ các khối u phổi của con người và mô lân cận bình thường. Kết quả là, các nhà nghiên cứu đã tạo ra danh sách các microprotein tiềm năng chức năng. Trong số các microprotein mà ShortStop tìm thấy, một số nổi bật đã được biểu hiện nhiều hơn trong mô khối u hơn mô bình thường. Điều này gợi ý rằng chúng có thể đóng vai trò là dấu ấn sinh học hoặc microprotein chức năng cho ung thư phổi. Việc xác định microprotein liên quan đến ung thư phổi này chứng minh giá trị của ShortStop và học máy trong việc ưu tiên các ứng viên cho nghiên cứu và phát triển điều trị trong tương lai.
Các nhà nghiên cứu hy vọng rằng ShortStop sẽ giúp họ tìm ra các microprotein mới liên quan đến sức khỏe và bệnh tật. Thông qua việc khám phá những microprotein này, họ hy vọng sẽ mở ra những con đường mới cho việc chẩn đoán và điều trị các bệnh như ung thư và Alzheimer. Điều này đánh dấu một bước tiến quan trọng trong lĩnh vực nghiên cứu y sinh, và hứa hẹn sẽ mang lại những hiểu biết mới về bản chất của các bệnh và cách điều trị chúng.
